由於長灘島非常小無法興建機場，因此目前得搭飛機到長灘島南邊的大島Panay，再搭船前往長灘島。Panay上有兩個機場（航程大約都是1小時）可選擇，Kalibo機場較大，可停國際班機，因此台灣飛往長灘包機皆飛到此機場，不過Kalibo機場距離長灘島較遠，抵達後需要轉巴士，巴士車程約1.5～2小時，沿途路況不好，最後抵達Caticlan碼頭，再搭船至長灘島。另一座Caticlan機場較小，只供國內小型螺旋槳飛機起降，由機場至Caticlan碼頭搭Tricycle只要10分鐘。
馬尼拉可搭飛機到前述兩機場，Kalibo機場票價會便宜很多，Caticlan機場由於只能飛小型飛機，即使已經有五家航空（PAL express、Philippine Airlines、Cebu Pacific Air、SEAIR、Zestair）每天各飛十多班，大量的外國遊客還是讓機票非常搶手。通常兩、三個月前才可以訂到便宜的價格。菲律賓的航空公司向來遭受到很多抱怨，Delay算正常，有時後給你好幾班併成一班飛，害你後面的航班接不上，又不負任何責任，這種狀況也不算少，因此建議選擇航空公司時，如果價錢沒有差非常多，優先選擇順序為Philippine Airlines > PAL express > Cebu Pacific Air > SEAIR > Zestair
